南方醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院前身是中國人民解放軍第一軍醫(yī)大學(xué)于1986年成立的醫(yī)學(xué)放射工程系，作為國內(nèi)較早成立生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)的單位，現(xiàn)為生物醫(yī)學(xué)工程一級(jí)學(xué)科博士、碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，廣東省攀峰重點(diǎn)學(xué)科、教育部高等學(xué)校第一類特色專業(yè)。

生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院秉承“以信息科學(xué)為基礎(chǔ)、以醫(yī)學(xué)成像為龍頭、以臨床應(yīng)用為依托、以產(chǎn)業(yè)需求為引導(dǎo)”的辦學(xué)方針，堅(jiān)持人才培養(yǎng)與科學(xué)研究并重發(fā)展。先后組建了醫(yī)學(xué)成像全軍重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（現(xiàn)廣東省醫(yī)學(xué)圖像處理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室）、數(shù)字化診療設(shè)備教育部工程研究中心等科研平臺(tái)，主要針對(duì)大型成像設(shè)備成像方法與醫(yī)學(xué)圖像分析展開系統(tǒng)性研究。曾研發(fā)了國內(nèi)首個(gè)X刀系統(tǒng)；建立了廣義模糊醫(yī)學(xué)圖像分析建模理論；提出了低劑量CT成像、快速M(fèi)RI成像、高分辨率PET成像、跨模態(tài)圖像映射等系列創(chuàng)新方法，研究的系統(tǒng)性與深度處于國內(nèi)領(lǐng)先水平。先后獲得國家科學(xué)技術(shù)發(fā)明二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，國家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)10多項(xiàng)；兩度獲得國家重大基礎(chǔ)研究計(jì)劃項(xiàng)目的資助；近五年獲得國家重點(diǎn)基金、國家重大儀器專項(xiàng)、國家科技支撐計(jì)劃、科技部十三五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等國家級(jí)項(xiàng)目90多項(xiàng)；在IEEE-TMI、TIP、TBME、Medical Image Analysis,Medical Physics、Physics in Medicine and Biology等權(quán)威期刊上發(fā)表學(xué)術(shù)論文250多篇。獲得國家發(fā)明專利授權(quán)85項(xiàng)。

生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院已建立起完整的“本-碩-博”三級(jí)人才培養(yǎng)體系，在校學(xué)生1229人。一條培養(yǎng)理工醫(yī)結(jié)合的復(fù)合型、卓越型人才的辦學(xué)之路已然成型——《培養(yǎng)理工醫(yī)結(jié)合的復(fù)合型人才研究》獲國家教學(xué)成果二等獎(jiǎng)（1997年），《生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科卓越人才培養(yǎng)模式的創(chuàng)新與實(shí)踐》獲國家教學(xué)成果二等獎(jiǎng)（2014年）。擁有以國家級(jí)教學(xué)名師為代表的一批優(yōu)秀教師，建設(shè)有國家級(jí)精品課程和國家級(jí)精品資源共享課，主編出版了醫(yī)學(xué)成像系列專著3本，教材20多部。

學(xué)科在國內(nèi)享有較高的聲譽(yù)，醫(yī)學(xué)成像與圖像分析研究水平處于國內(nèi)領(lǐng)先水平，在人才培養(yǎng)與產(chǎn)業(yè)支撐方面均有一定成就，具有較高的學(xué)術(shù)地位。多名骨干成員先后擔(dān)任教育部生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)副主任委員、中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會(huì)副理事長、中國圖像圖形學(xué)會(huì)副理事長、中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)圖像處理與控制分會(huì)主任委員、科技部醫(yī)學(xué)成像設(shè)備產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟理事長、科技部重大項(xiàng)目醫(yī)療器械專項(xiàng)專員組組長等。

生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院注重科研成果的轉(zhuǎn)化，與沈陽東軟等國內(nèi)知名企業(yè)有長期穩(wěn)定的合作關(guān)系，實(shí)施橫向合作項(xiàng)目100多項(xiàng)，專利成果轉(zhuǎn)化20多項(xiàng)。研究成果孵化兩家公司，分別從事醫(yī)院信息化管理軟件開發(fā)與醫(yī)療設(shè)備的第三方檢測(cè)平臺(tái)技術(shù)服務(wù)，取得了良好的經(jīng)濟(jì)與社會(huì)效益。