水資源與環(huán)境工程學院是在1960年創(chuàng)辦的放射性水文地質本科專業(yè)發(fā)展起來的。1985年與北京核工地質研究院開始聯(lián)合招收和培養(yǎng)水文地質與工程地質碩士研究生，1993年獲得水文地質與工程地質碩士學位授權點，開始獨立招收和培養(yǎng)水文地質與工程地質碩士研究生。2002年獲得地質資源與地質工程一級學科碩士學位授權點，同時獲得地質工程領域碩士學位授權點。2003年獲得環(huán)境工程碩士學位授權點。2010年獲得水利工程、環(huán)境科學與工程一級學科碩士學位授權點，同時獲得水利工程、環(huán)境工程領域碩士學位授權點。2012年獲得地質資源與地質工程一級學科博士學位授權點。

水資源與環(huán)境工程學院現(xiàn)有在校本科生800多人，研究生80多人（含博士生）。擁有一支教授、副教授為骨干，博士、碩士為主體，結構合理、學術水平較高的專業(yè)師資隊伍。現(xiàn)有專任教師40多人，其中有博士生導師3人，正高8人、副高13人，有博士學位23人、碩士學位17人。擁有俄羅斯自然科學院外籍院士1人，國家杰出青年科學基金項目獲得者1人，享受國務院特殊津貼專家1人，全國優(yōu)秀教師1人，江西省百千萬人才工程1人，江西省教學名師1人，江西省高校中青年學科帶頭人4人，江西省高校中青年骨干教師2人，“贛鄱英才555工程”領軍人才2人，東華理工大學教學名師2人。擁有“水文與水資源工程”江西省教學創(chuàng)新團隊，“水文與水資源工程專業(yè)核心課程群”東華理工大學教學團隊和“水污染控制工程”東華理工大學教學培育團隊。擁有“鈾資源勘查與鈾礦產(chǎn)品提取技術”國家國防科工局科技創(chuàng)新團隊和“環(huán)境污染機理與修復”東華理工大學科技創(chuàng)新團隊。

水資源與環(huán)境工程學院擁有地質資源與地質工程一級學科博士學位授權點。擁有水利工程、環(huán)境科學與工程和地質資源與地質工程3個一級學科碩士學位授權點，水利工程、環(huán)境工程、地質工程3個工程碩士領域學位授權點。擁有水文與水資源工程、環(huán)境工程、給排水科學與工程和地下水科學與工程4個本科專業(yè)。水文與水資源工程專業(yè)，2003年獲江西省品牌專業(yè)，2008年獲國家級特色專業(yè)，2013年獲江西省卓越工程師教育培養(yǎng)計劃試點專業(yè)。該專業(yè)學科先后榮獲原核工部及江西省“九五”重點學科，以其為基礎的“地質工程”學科榮獲江西省“十五”、“十一五”重點建設學科，“地質資源與地質工程”學科榮獲江西省“十二五”高水平學科。環(huán)境工程專業(yè)，2004年獲江西省品牌專業(yè)，2008年獲江西省特色專業(yè)，2014年獲江西省專業(yè)綜合改革試點專業(yè)。

水資源與環(huán)境工程學院堅持“以學生為本，培養(yǎng)高素質人才”為目標，全方位提高學生的專業(yè)實踐能力、創(chuàng)新能力和就業(yè)能力，為國家建設培養(yǎng)高素質有用人才。水資源與環(huán)境工程學院實驗教學中心設施齊全，擁有國家級和省級實驗教學示范中心。設有基礎水文地質、水文地質工程地質勘察、水質分析與環(huán)境監(jiān)測、環(huán)境微生物、水處理、環(huán)境工程、水力學、水泵與管網(wǎng)、建筑給排水等專業(yè)基礎與專業(yè)實驗室。建立了杭州地質認識、江山區(qū)域地質調查、撫州市洪門水庫、撫州臨川溫泉、中國石油化工股份有限公司九江分公司、江西省水文地質工程地質大隊、江西省地質環(huán)境監(jiān)測總站、江西省核工業(yè)267大隊、寧波大學地基處理技術有限公司、廣東順德工業(yè)設計研究院、上海清浥環(huán)保科技有限公司、南昌水業(yè)集團環(huán)保能源公司等專業(yè)教學實習基地以及中核撫州金安鈾業(yè)公司、新疆中核天山鈾業(yè)有限公司“產(chǎn)、學、研”教學與科學研究基地。水資源與環(huán)境工程學院培養(yǎng)的畢業(yè)生得到了用人單位的一致好評，畢業(yè)生就業(yè)前景廣闊。近5年畢業(yè)生一次性就業(yè)率達到85%以上，平均考研率超過18%。

水資源與環(huán)境工程學院充分利用自身學科與專業(yè)優(yōu)勢，積極開展科學研究工作。近5年，先后主持國家自然科學基金、國家科技部“863” 和“973”、國家國防科工局等國家級科研項目26項，以及省部級科研項目30余項，年到賬科研經(jīng)費800多萬元，科研成果獲江西省科技進步獎二等獎1項、獲教育部自然科學獎二等獎1項，獲發(fā)明專利3項。發(fā)表高水平的學術論文200余篇，其中被SCI、EI、ISTP收錄近50篇，出版專著4部。

水資源與環(huán)境工程學院積極開展對外交流。水資源與環(huán)境工程學院教師先后赴美國、俄羅斯、加拿大、德國、日本、冰島、英國、阿根廷、捷克、西班牙等國家進行合作研究與學術交流。先后與德國波鴻大學、英國威爾士大學、冰島聯(lián)合國大學、烏茲別克斯坦科學院微生物研究所、俄羅斯托姆斯克理工大學等知名大學建立了良好的科研合作關系，確保學科建設始終位列世界前沿。